داستان فیلم بعد از جنگ داخلی و قبل از جنگ ابدیت رخ میدهد و گریزی به گذشتهٔ ناتاشا رومانوف هم میزند و به صورت فلش بک کوتاه اتفاقی که برای هاکای و ناتاشا در بوداپست افتاد را توضیح میدهد. در پی وقایع کاپیتان آمریکا: جنگ داخلی، ناتاشا رومانوف در پی نافرمانی از توافقنامه سوکوویا و کمک به استیو راجرز، تنها شده و تحت تعقیب دولت قرار گرفتهاست و به شهر بوداپست میرود و اتفاقات جدیدی میافتد.