Les Cervellators, lancés par un cerveau inconnu, sont envoyés sur la planète Makuhero, où ils infectent et possèdent les nombreuses créatures indigènes. Elles se regroupent pour former une armée d’invasion et lancent une attaque sur Makuhero City. Les héros, en plein milieu d’un événement publicitaire célébrant leurs accomplissements pour « Mission : Catch ‘Em and Cuff ‘Em », sont envoyés à l’usine pour recevoir des améliorations afin de combattre les créatures. Furno est nommé commandant de la mission et dirige de nombreuses équipes pour tenter de vaincre les Cervellators. Rocka affronte un énorme dragon à l’aide d’un jetpack, tandis que Surge est possédé par un Cervellator et utilise la Tour d’Assemblage pour créer une armée de drones Héros « vierges » et sans âme. En travaillant ensemble, Alpha 1 parvient à libérer toutes les créatures et Surge du contrôle des Cervellators, et à vaincre les drones. Lors du nettoyage de la bataille, on découvre que d’autres Cervellators se cachent sous l’usine, dans les tunnels créés par l’infiltration de Dragon Bolt. Les ouvriers qui travaillent dans les tunnels sont alors attaqués par l’un des Cervellators.
