هرکدام از آکادمی‌های شهر به یک ناحیه تقسیم شده‌اند و عمدتا مستقل در نظر گرفته می‌شوند.
شورای دانش آموزشی به عنوان یک هیئت مدیره برای مدیریت آکادمی‌ها عمل می‌کند. با این حال، توانایی این گروه برای مدیریت بعد از ناپدید شدن مرموز رئیس شورای عمومی دانش آموزی متوقف شده است. در غیاب رئیس شورای دانش آموزی، مشکلات بی‌شماری در سراسر کیووتوس رخ داده است.
برای جلوگیری از فاجعه، شورای عمومی دانش آموزی از کلاب تحقیقات فدرال، که به نام "شاله" شناخته می‌شود، درخواست کمک می‌کند. درواقع، "شاله" آخرین کلابی است که قبل از ناپدید شدن رئیس شورای دانش آموزی تایید شده است.
"شاله" برای انجام وظیفه خود و حل حوادث اطراف کیووتوس به راهنمایی یک سنسی تکیه می‌کند.