فن کویل سقفی این نوع از فن کویلها همانطور که از نام آنها مشخص است، در قسمت سقف نصب میشوند و با توجه به نوع معماری در دو مدل سقفی توکار و سقفی روکار، طراحی و تولید میگردند. فن کویلهای سقفی روکار که معمولاً بصورت کابین دار ساخته میشوند، در سالهای اخیرکمتر استفاده میشوند؛ ولی سیستمهای سقفی توکار که در زیرسقف کاذب استفاده میشوند، بسیار پر مصرفتر هستند. این مدل دارای انواع مختلفی است؛ از جمله فن کویل سقفی ساده، کاستی (یک طرفه و چهار طرفه) و فن کویلهای کانالی که به نام داکت فن کویل نیز معروفند.