در فیلم قطب های متضاد، اِما ریورا پس از تماس اضطراری پدرش، محقق پنگوئنها در قطب جنوب، سفری پرماجرا را آغاز میکند. او در کشتی تحقیقاتی با اندی جکسون آشنا میشود و با او برای نجات یک پنگوئن به نام لولا که آسیبدیده همراه میشود. در این سفر پرخطر و احساسی، رابطهای رمانتیک میان اِما و اندی شکل میگیرد....