شهید رئیسی از سال ۱۳۶۸ تا ۱۳۷۳ دادستان تهران و سپس ۱۰ سال رئیس سازمان بازرسی کل کشور بود؛ سازمان بازرسی کل کشور در زمان تصدی ایشان با توسعه متوازن ساختاری مواجه شد و به عنوان یکی از ارکان نظارتی نظام جمهوری اسلامی تثبیت شد.
سال ۱۳۸۳ بود که شهید آیت الله رئیسی به سمت معاون اول قوه قضائیه منصوب شد و ۱۰ سال در این سمت باقی ماند که همزمان با دوره ۵ ساله دوم ریاست مرحوم آیت الله هاشمی شاهرودی و دوره نخست آیت الله آملی لاریجانی بر قوه قضائیه بود.
رئیس جمهور فقید ایران اسفند ۱۳۹۴ به مشهد رفت و پس از درگذشت آیت الله واعظ طبسی، تا اسفند ۱۳۹۷ به مدت ۳ سال تولیت آستان قدس رضوی را عهده دار شد در این سال ها بود که مدال افتخار خادم الرضا (ع) بر سینه مرد تقوا و عمل نشست و در این مدت کوتاه، زمینه ساز تغییرات گسترده در ساختار اداره آستان قدس رضوی (ع) به سود محرومان و زائران و مجاوران حضرت علی بن موسی الرضا (ع) شد.
سید محرومان سپس از اسفند ۱۳۹۷ به قوه قضائیه برگشت و ریاست این قوه را بر عهده گرفت و با مدیریتی وصف ناپذیر، تراز این دستگاه را پس از چند دهه ارتقا داد؛ رسیدگی فوری به پرونده ها و مشکلات قضایی مردم، بررسی قاطع پرونده های فساد و نهایتا تدوین و نهایی کردن سند تحول قضایی و هوشمندسازی قوه قضائیه که تحولی مهم در اداره این قوه به شمار می رفت، از به یادماندنی ترین اقدامات آیت الله رئیسی در این جایگاه بود.