خلاصه داستان: دوازده سال پیش، یک روباه دیو عظیم الجثه جهان را به وحشت انداخت. در طول حمله هیولا به دهکده برگ پنهان، هوکاگه - رهبر دهکده و قدرتمندترین نینجا - خود را قربانی می کند تا جانور درون یک نوزاد تازه متولد شده را مهر و موم کند و تمدن را از نابودی رها کند و کودک را محکوم به یک زندگی تنهایی کند.
اکنون، پس از سالها طرد شدن و آزار و اذیت شدن، ناروتو اوزوماکی با شوخیها و خرابکاریهای پیچیده روستا را آزار میدهد. با وجود این شیطنتها، او سخت تلاش میکند تا به آرزویش برسد: هوکاگه شود و قدردانی کسانی را که در تمام عمرش با او بدرفتاری کردهاند به دست آورد. ناروتو به تیم 7 میپیوندد، یک تیم نینجا متشکل از دو نفر از همتایان او - اعجوبه ساسوکه اوچیها و ساکورا هارونو باهوش.
تحت رهبری کاکاشی هاتاکه، تیم 7 مجموعه ای از ماموریت های دشوار را بر عهده می گیرد و اعضای خود را مجبور می کند با وجود تفاوت های زیاد، از نظر قدرت و رفاقت رشد کنند. ناروتو تلاش می کند تا در رقابت خود با ساسوکه برجسته شود و محبت عاشقانه ساکورا را به دست آورد. اما در حالی که این سه نفر در برابر خطر و مرگ مبارزه می کنند، گذشته غم انگیز آنها تهدید می کند که آنها را از هم بپاشد...