مراحل بیماری آشالازی مرحله اول در این مرحله اسفنکتر تحتانی به درستی باز نمی شود و انقباضات بخش پایینی مری ضعیف یا متناوب است. در این مرحله دیسفاژی (مشکل بلع) خفیف است و بیماران با یادگیری تجربی، عادات غذایی خود را متناسب با این مشکل تنظیم می کنند. اگر در این مرحله درمان مناسب انجام شود، پیش آگهی آن عالی است و می تواند از پیشرفت علائم جلوگیری کند. مرحله دوم در صورتی که برای درمان اقدام نشده باشد، به تدریج اعصاب و ماهیچه ها آسیب می بینند و عملکرد مری و اسفنکتر تحتانی با شکست روبرو می شود. مرحله سوم در این مرحله آشالازی شدید می شود و بجز اختلال در عملکرد اسفنکتر تحتانی، اسپاسم های (انقباضات) فشار قوی ایجاد می شود که احتمالاً به منظور جبران انسداد ناشی از تنگی اسفنکتر انجام می شود.