جلسه هیأت دولت صبح چهارشنبه (۱۶ مهر) به ریاست حسن روحانی برگزار شد. رئیس‌جمهور در این جلسه ضمن اشاره به موضوعاتی نظیر مناقشه قره‌باغ، فعالیت‌های دولت در حوزه خدمات روستایی و تشدید کنترل‌های کرونایی، به انتقادها از لغو جلسه سران قوا به دلیل حضور رئیس مجلس در بخشی کرونای یکی از بیمارستان‌ها و تاکید ستاد ملی کرونا بر لزوم رعایت سران سه قوه، اشاره کرد و گفت: هیچکس حق ندارد پروتکل‌ها را رعایت نکند. خدا به ما عقل داده و عقل حکم می‌کند که از جان خود و جان دیگران محافظت کنیم.