عمل جراحی خارج کردن آپاندیس «آپاندکتومی» نامیده می شود. در عمل جراحی باز پس از آماده و بیهوش کردن بیمار، برش کوچکی در قسمت راست و پایین شکم داده می شود. آپاندیس از زخم بیرون کشیده شده و ته آن گره زده می شود و تمامی آن خارج می گردد و ته مانده آن با چند بخیه در جدار روده دفن می شود. در عمل جراحی لاپاروسکوپی میتوان از گره بخیه، کلیپس ویا استاپلر استفاده کرد.