روش لاپاراسکوپی به طور گسترده ای به عنوان درمان جراحی تومورهای زیر مخاطی دستگاه گوارش پذیرفته شده است. اندیکاسیون برای روش لاپاراسکوپی مربوط به اندازه تومور بوده است. حد بالایی اندازه تومور، طبق روندهای اخیر، افزایش یافته است و هیچ دستورالعمل مشخصی برای حد پایین وجود ندارد. در حالی که اصل رزکسیون موضعی با حاشیه رزکسیون منفی حفظ می شود، تکنیک های جراحی مختلف بسته به محل و پیکربندی تومور مورد نیاز است. روش اگزوگاستریک عمدتاً برای تومورهای اگزوفیتیک در دیواره قدامی معده استفاده می شود. اگر تومورهای زیر مخاطی دستگاه گوارش در دیواره خلفی معده قرار داشته باشند، روش مناسب با توجه به اگزوفیتیک یا اندوفیتیک بودن تومور اتخاذ می شود. اگر امکان بسیج و چرخاندن معده وجود داشته باشد، می توان از روش اگزوگاستریک برای ضایعه اگزوفیتیک استفاده کرد. با این حال، یک ضایعه اندوفیتیک بیشتر به رویکردهای پیچیده تری نیاز دارد، زیرا محل تومور در طی جراحی لاپاراسکوپی آسان نیست. به طور کلی، می توان از روش ترانس گاستریک یا اینتراگاستریک استفاده کرد.